Различают две формы отбора: массовый и индивидуальный.
Массовый отбор основан на отборе по фенотипу. Отбираются особи, отвечающие определенному стандарту, но один и тот же фенотип может быть обусловлен различными генотипами, а один и тот же генотип может дать (в пределах нормы реакции) различные фенотипы.
Некоторые ценные признаки проявляются лишь у одного из полов, например, количество и качество молока, яйценоскость и т.п. По фенотипу определить генотип самца невозможно, поэтому отбор лишь по фенотипу не дает возможности оценить наследственные свойства производителей. Это, естественно, замедляет достижение цели, намеченной селекционером.
Индивидуальный отбор базируется на выделении особей с известным генотипом, определенным по продуктивности потомства. Поэтому при индивидуальном отборе желаемый результат достигается значительно быстрее.
При отборе работа селекционера начинается с создания группы особей с одинаковыми генотипами. Наиболее легко их получить у самоопыляемых растений.
Потомство одного самоопыляемого организма, имеющее однородный гомозиготный генотип, называется чистой линией.
Однородность генотипа у перекрестноопыляемых растений и у животных достигается близкородственным размножением (инбридингом). И этим путем тоже может быть получена группа особей с одинаковым гомозиготным генотипом. Они получили название инбредных линий.
Генотип чистых и инбредных линий более или менее стабилен, но и в них происходят мутации, так что их стабильность не абсолютна. Чистые и инбредные линии имеют сниженную жизнеспособность, поэтому в селекционной практике обычно создают несколько чистых (или инбредных) линий, между которыми в дальнейшем проводят скрещивание. Такой прием называется межлинейной гибридизацией, которая в ряде случаев приводит к созданию высокопродуктивных растений и животных.
